如果你手上有 miRNA 表达谱，却卡在「靶基因预测结果一大堆、到底哪些边该连上」这一步，这门课解决的就是这个环节。它不讲 miRNA 的生物学发现史，也不铺开讲转录组整体流程，重点只有一个：把 miRNA 与靶基因之间的调控关系，落成一张能看、能算、能解释的网络图。

先说清楚它适合谁、不适合谁

适合两类人。一类是做生物信息分析、手里有 miRNA 和 mRNA 表达数据，但网络构建靠现成脚本跑一遍、结果说不清为什么的人。另一类是算法方向的学习者，想找一个具体场景练手，看看数据挖掘的方法怎么落在生物调控关系上——因为 miRNA 调控网络天然带有「预测结果多、假阳性高、需要多源证据交叉验证」的特点，很适合拿来练特征筛选和关系推断。

不适合谁？如果你连 miRNA 是什么、种子序列配对规则都没概念，直接看会有点吃力，建议先补分子生物学基础。另外，指望它教会你写一套完整分析流程代码的，也会失望——它的落点在方法与工具的使用逻辑，不在从零造轮子。

课程真正会碰到的几个卡点

第一个卡点是调控关系的来源。靶基因预测软件各说各话，保守性、结合位点、自由能阈值都会影响结果，课程从构建调控关系的理论讲起，帮你理清「一条边凭什么成立」，而不是拿到预测表就直接画图。

第二个卡点是数据挖掘环节怎么介入。表达相关性、共表达模式、负相关筛选，这些手段是把预测清单压缩成可信清单的关键，也是不少人在实际项目里最缺的一步。

第三个卡点是网络画出来之后的处理。拓扑属性怎么算、hub 节点怎么界定、图怎么调才既美观又能放进论文，课程用 Cytoscape 这一段专门解决，附带的操作文档和演示可供反复回看。

配套练习建议这样用

跟着理论部分走一遍时，先别急着动手，把「靶基因预测—表达验证—网络构建—拓扑分析」这条链路的每一步输入输出写清楚，再回头对视频。
看 Cytoscape 部分时同步操作，重点练导入边列表、设置节点属性、按度值调节点大小和颜色这三件事，练完换一份自己的数据复现一遍。
拿到预测结果后，主动做一次「只留交集」和「按相关性过滤」的对比，看网络规模和 hub 节点变化多少，这个对比比看十遍视频有用。

看完应该能回答的问题

学完这门课，你至少应该能自己回答：为什么同一个 miRNA 在不同预测工具下靶基因数量差这么多？构建网络时边的权重一般用什么来定？Cytoscape 里度和介数中心性分别说明节点的什么特征？如果一个 hub 基因在你的数据里表达变化不明显，该怎么解释？这些问题答不上来，说明还停留在「会点按钮」的阶段，值得把理论部分再刷一遍。

最后提一句：miRNA 调控网络是数据挖掘在生物领域里比较典型的应用场景，做完这一套，你迁移到 lncRNA、转录因子调控网络时，思路基本是通的。缺的是具体方法的经验，那就补具体方法，别绕。

网易云课堂-数据挖掘—miRNA调控网络构建

miRNA调控网络构建实战教程

编辑点评

深入解析miRNA调控网络构建方法，理论与实践结合，适合生物信息学及算法爱好者。

⭐ 编辑推荐

掌握miRNA调控网络构建技术，学习数据挖掘在生物信息学中的应用。

课程涵盖：调控关系理论、网络构建工具、算法应用等。

课程亮点

• miRNA调控网络构建方法解析

• 实战案例教学

• 生物信息学应用

课程目录

📁 02、构建调控关系理论
    02、构建调控关系理论文档.png  [493.5 KB]
    01、构建调控关系理论.mp4  [18.9 MB]
    02、构建调控关系理论.mp4  [66.5 MB]
    03、构建调控关系理论.mp4  [141.7 MB]
📁 08、cytoscape构建网络
    08、cytoscape构建网络文档.zip  [1.8 MB]
    02、cytoscape构建网络.mp4  [105.8 MB]
    01、cytoscape构建网络.mp4  [60.0 MB]
📁 03、WGCNA理论
    04、WGCNA理论.mp4  [53.2 MB]
    01、WGCNA理论.mp4  [24.3 MB]
    02、WGCNA理论.mp4  [18.9 MB]
    03、WGCNA理论.mp4  [21.0 MB]
📁 09、数据库预测
    09、数据库预测资料.png  [493.5 KB]
    01、数据库预测.mp4  [47.5 MB]
    04、数据库预测.mp4  [96.8 MB]
    02、数据库预测.mp4  [272.3 MB]
    03、数据库预测.mp4  [44.6 MB]
📁 05、提取蛋白编码基因
    05、提取蛋白编码基因说明.zip  [1.8 MB]
    02、提取蛋白编码基因.mp4  [51.9 MB]
    04、提取蛋白编码基因.mp4  [56.8 MB]
    01、提取蛋白编码基因.mp4  [65.0 MB]
    03、提取蛋白编码基因.mp4  [56.9 MB]
    05、提取蛋白编码基因.mp4  [105.1 MB]
📁 07、基于算法构建调控
    07、基于算法构建调控必看.png  [493.5 KB]
    02、基于算法构建调控.mp4  [58.4 MB]
    03、基于算法构建调控.mp4  [54.6 MB]
    01、基于算法构建调控.mp4  [64.7 MB]
    04、基于算法构建调控.mp4  [64.9 MB]
📁 01、TCGA概述
    01、TCGA概述资料.png  [493.5 KB]
    02、TCGA概述.mp4  [17.6 MB]
    03、TCGA概述.mp4  [37.1 MB]
    01、TCGA概述.mp4  [68.5 MB]
📁 04、数据下载
    01、数据下载.mp4  [55.2 MB]
    04、数据下载.mp4  [96.1 MB]
    03、数据下载.mp4  [47.1 MB]
    02、数据下载.mp4  [52.1 MB]
📁 06、差异分析
    01、差异分析.mp4  [52.2 MB]
    02、差异分析.mp4  [41.6 MB]
    03、差异分析.mp4  [98.3 MB]
医学方miRNA调节网络的构建配套代码.zip  [196.1 MB]